Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RargP18911 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RargP18911 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RargP18911 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RargP18911 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RargP18911 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RargP18911 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RargP18911 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RargP18911 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RargP18911 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RargP18911 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RargP18911 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RargP18911 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms