Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sdc1P18828 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms