Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms