Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30aP15533 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim30aP15533 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms