Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme1P15532 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme1P15532 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme1P15532 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme1P15532 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme1P15532 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms