Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SptbP15508 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SptbP15508 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SptbP15508 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SptbP15508 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SptbP15508 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SptbP15508 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SptbP15508 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SptbP15508 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SptbP15508 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SptbP15508 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SptbP15508 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SptbP15508 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SptbP15508 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms