Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrphP15331 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrphP15331 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrphP15331 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrphP15331 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrphP15331 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrphP15331 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrphP15331 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrphP15331 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrphP15331 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrphP15331 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrphP15331 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms