Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb1P13372 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms