Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkar1bP12849 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1bP12849 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms