Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr4a1P12813 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms