Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtcP11725 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtcP11725 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtcP11725 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtcP11725 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtcP11725 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtcP11725 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtcP11725 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtcP11725 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtcP11725 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtcP11725 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtcP11725 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtcP11725 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtcP11725 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtcP11725 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtcP11725 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtcP11725 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtcP11725 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms