Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UbbP0CG49 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UbbP0CG49 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UbbP0CG49 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UbbP0CG49 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UbbP0CG49 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UbbP0CG49 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbbP0CG49 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbbP0CG49 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UbbP0CG49 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms