Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb8P09632 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb8P09632 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms