Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms