Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Spta1P08032 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Spta1P08032 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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