Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms