Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa4P06798 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa4P06798 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms