Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06344 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06344 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06344 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06344 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06344 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms