Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06336 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06336 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06336 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06336 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06336 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P06336 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06336 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06336 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06336 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06336 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06336 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06336 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06336 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06336 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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