Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06321 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06321 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06321 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06321 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06321 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms