Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Eb1P04230 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms