Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt1P04104 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt1P04104 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms