Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms