Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01822 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01822 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01822 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01822 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01822 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01822 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01822 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01822 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01822 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms