Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01809 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01809 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01809 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01809 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01809 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01809 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01809 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01809 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01809 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01809 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01809 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms