Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01680 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01680 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01680 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01680 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01680 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01680 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms