Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01653 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01653 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01653 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01653 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01653 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01653 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01653 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms