Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01648 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01648 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01648 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01648 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01648 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01648 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01648 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01648 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01648 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01648 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01648 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01648 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01648 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01648 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01648 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms