Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01629 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01629 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01629 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01629 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01629 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms