Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifnb1P01575 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms