Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MscO88940 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MscO88940 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MscO88940 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MscO88940 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MscO88940 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MscO88940 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MscO88940 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms