Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd7O88665 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms