Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnmt3bO88509 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms