Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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