Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms