Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms