Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lnx1O70263 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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