Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx3O55144 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms