Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms