Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms