Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sema6bO54951 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms