Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2a2O54833 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2a2O54833 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms