Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FxnO35943 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FxnO35943 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FxnO35943 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FxnO35943 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FxnO35943 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FxnO35943 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FxnO35943 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FxnO35943 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FxnO35943 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FxnO35943 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FxnO35943 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FxnO35943 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FxnO35943 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms