Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek2O35942 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek2O35942 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms