Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppfibp2O35711 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms