Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Atf6bO35451 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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