Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms