Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dgcr6O35347 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Dgcr6O35347 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dgcr6O35347 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dgcr6O35347 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms