Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kpna3O35344 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna3O35344 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms