Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms